Dưới thời Việt Nam Cộng hòa, địa bàn thị trấn Thới Bình hiện nay thuộc xã Thới Bình và là nơi đặt quận lỵ quận Thới Bình.

Sau năm 1975, quận Thới Bình đổi thành huyện Thới Bình. Đồng thời, chính quyền tách một phần diện tích và dân số của xã Thới Bình để thành lập thị trấn Thới Bình, thị trấn huyện lỵ Thới Bình.